狂犬疫苗打三针和打五针主要在接种程序和适用情况上有区别。一般来说，狂犬疫苗打五针的程序是第0、3、7、14、28天各接种1针，而打三针的程序是第0、7、21天各接种1针。
接种程序方面
五针接种程序： 全程需要接种5次，时间间隔较为规律，第0天接种1针，然后分别在第3天、第7天、第14天、第28天各接种1针。这种程序是较为传统且被广泛认可的常规接种方式，能让体内产生较为稳定且持久的抗体应答。三针接种程序： 全程接种3次，第0天接种1针，第7天接种1针，第21天接种1针。相对五针程序，接种次数减少，时间间隔相对较长。
适用情况方面
五针适用情况： 适用于大多数初次暴露需要接种狂犬疫苗的情况。比如被较为可疑的动物咬伤、抓伤，且无法确定动物是否健康时，通常会采用五针接种程序来确保产生足够的抗体以预防狂犬病。三针适用情况： 一般适用于经过严格评估后的特定暴露情况。例如，经过WHO认可的特定疫苗产品，在符合一定条件的暴露情况下可以采用三针接种程序，不过这种情况相对受限，需要专业医生根据暴露的具体情况进行判断，比如暴露程度较轻且经过科学评估后认为可以采用三针程序。
免疫效果方面
五针免疫效果： 由于接种次数较多，体内抗体产生的峰值相对较高，而且持续时间相对较长。有研究表明，五针接种程序能使体内抗体在较长时间内维持在较好的水平，对于预防狂犬病能提供较为全面的保护。三针免疫效果： 三针接种程序也能刺激机体产生有效的抗体，但抗体产生的峰值可能相对五针程序稍低一些，不过在合理的暴露情况下，也能达到有效的免疫保护效果。但需要注意的是，三针程序并非适用于所有暴露情况，必须严格遵循专业评估后的结果来选择。