扁平疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，其中HPV - 3型是引起扁平疣的主要病原体。一般来说，当人体皮肤黏膜有破损时，HPV就容易侵入并感染上皮细胞，从而引发扁平疣。
病毒传播途径
直接接触传播： 比如与扁平疣患者直接的皮肤接触，就有可能被传染。比如一起握手、拥抱等近距离的皮肤接触行为，都可能让病毒从患者身上转移到健康人皮肤上。间接接触传播： 通过接触被患者污染的物品也能感染。像共用毛巾、脸盆等个人物品，就存在感染风险。如果健康人接触了被扁平疣患者污染过的毛巾，而自身皮肤又有细微破损，就可能被HPV感染。
自身因素影响
免疫力低下人群： 当人体免疫力较低时，比如长期熬夜、过度劳累、患有慢性疾病等情况，身体抵御HPV的能力下降，就更容易感染扁平疣。例如，长期熬夜的人，身体免疫系统功能会受到影响，相比作息规律的人，感染扁平疣的几率会增加。皮肤有破损者： 皮肤出现破损，无论是外伤导致的还是因为搔抓等造成的，都为HPV的入侵提供了便利条件。比如皮肤被划伤，此时皮肤的屏障功能受损，HPV就更容易感染上皮细胞，进而引发扁平疣。
好发人群特点
青少年群体： 青少年时期身体的免疫系统还在发育过程中，相对比较脆弱，所以更容易感染HPV引发扁平疣。据统计，16 - 30岁年龄段的人群中扁平疣的发病率相对较高，其中青少年是高发群体之一。皮肤易受损人群： 像经常从事户外工作，皮肤容易受到外伤的人，或者是有不良卫生习惯，经常搔抓皮肤的人，都属于皮肤易受损人群，这类人群感染扁平疣的可能性比一般人要大。比如建筑工人，由于工作中皮肤容易受伤，感染扁平疣的风险相对较高。