怀孕初期总是肚子疼可能是以下原因引起：
一、正常生理现象：怀孕后女性体内激素水平改变，雌激素与孕激素分泌增加，这可能影响胃肠神经，且怀孕初期受精卵着床时会对子宫产生刺激，从而导致怀孕初期总是肚子疼。若没有其他不适症状，此为正常生理现象。此时女性应注意卧床休息，同时要放松自身心态。
二、先兆流产：因胚胎发育不良、药物影响、黄体功能不全等因素可能引发先兆流产，出现阴道少量出血、腹痛等表现，造成怀孕初期总是肚子疼。这种情况下女性需及时就医，一般可在医生指导下使用如黄体酮栓、保胎灵片、孕康口服液等药物进行保胎治疗。
三、异位妊娠：输卵管畸形、输卵管粘连可导致受精卵在输卵管部位受阻，受精卵未进入子宫腔而在输卵管处着床，胚胎发育可能致使输卵管破裂，引起怀孕初期总是肚子疼。此时女性必须及时终止妊娠，一般可通过输卵管切除术进行治疗，以避免大出血。
总结提示：怀孕初期肚子疼的原因多样，要注意区分正常与异常情况，一旦有异常表现应及时采取相应措施。