功能性消化不良能否自愈需视患者病情而定。具体如下：
一、能自愈的情况
功能性消化不良多由饮食因素、不良生活习惯等引起。若病情较轻，未出现明显器质性病变，且患者养成良好的饮食和生活习惯，通常是能够自愈的。比如患者调整饮食习惯，做到规律进食，避免暴饮暴食，减少辛辣、油腻、刺激性食物的摄入；同时保持规律作息，避免熬夜，适度运动等，有助于病情的恢复。
二、不能自愈的情况
若患者病情严重，已发生器质性病变，如引发慢性胃炎、胃食管反流等，且出现明显的腹胀、反酸、嗳气、呕吐、恶心等不适症状，通常难以自愈。这时需要在医生指导下使用药物进行治疗，常用药物有雷贝拉唑钠肠溶片、泮托拉唑肠溶片、雷贝拉唑钠肠溶片等。在治疗期间，患者要避免暴饮暴食以及进食油腻、刺激性食物，以免加重病情。
总之，对于功能性消化不良患者，要根据具体病情来判断是否能自愈，病情严重时需积极治疗并注意相关事项。