结肠癌的发病原因较为复杂，目前研究表明，大约有10%-30%的结肠癌与遗传因素相关，比如家族性腺瘤性息肉病患者，其后代患结肠癌的风险明显升高。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 某些遗传性综合征会大幅增加结肠癌发病风险，像林奇综合征，这是一种常染色体显性遗传病，患者体内存在DNA错配修复基因的突变，使得发生结肠癌的几率比正常人高出数倍，通常在40岁左右就可能发病。基因突变影响： 一些特定的基因突变，例如APC基因、KRAS基因等的突变，会干扰细胞的正常生长和分裂，进而引发结肠细胞癌变。
生活方式因素
饮食结构不合理： 长期高脂肪、低纤维的饮食是结肠癌的重要诱因。高脂肪饮食会使胆汁酸分泌增多，在肠道细菌作用下转化为致癌物质；而低纤维饮食会导致肠道蠕动减慢，粪便在肠道内停留时间延长，有害物质与肠黏膜接触时间增加。有研究发现，每日脂肪摄入量超过总热量30%的人群，结肠癌发病率比脂肪摄入量低于15%的人群高2倍左右。缺乏运动： 运动量过少会影响肠道蠕动功能，降低身体的代谢和免疫能力。长期久坐不动的人，结肠癌发生风险比经常运动的人要高约1.5倍。
肠道疾病因素
肠道慢性炎症： 如溃疡性结肠炎，病程超过10年的溃疡性结肠炎患者，发生结肠癌的几率比正常人高10-20倍。由于肠道长期处于炎症状态，肠道黏膜不断修复再生，容易引发基因突变，从而增加癌变可能性。肠息肉： 尤其是腺瘤性息肉，这是结肠癌的癌前病变。一般直径大于2厘米的腺瘤性息肉，癌变几率超过50%。如果不及时处理，经过数年甚至更长时间，腺瘤性息肉很可能发展为结肠癌。