女性巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种常见类型，其症状表现多样。约1/3的患者可能没有明显症状，但多数患者会出现以下情况。
一、月经相关症状
痛经： 这是比较常见的症状，多为继发性痛经，且呈进行性加重。通常从月经前1 - 2天开始出现，月经第一天最严重，以后逐渐减轻，可延续至整个经期。有的患者痛经程度较重，甚至影响日常生活和工作。月经异常： 可能出现月经量增多、月经周期紊乱等情况。比如月经量较以往明显增多，月经周期提前或推迟等。有的患者月经量增多是因为囊肿影响了卵巢的正常功能，导致激素分泌紊乱，进而影响子宫内膜的生长和脱落。
二、盆腔相关症状
盆腔疼痛： 除了痛经外，还可能有盆腔的慢性疼痛。在非月经期间也可能出现下腹部的隐痛或胀痛，尤其是在性生活时可能会感到疼痛。这种疼痛可能会持续存在，给患者带来持续的不适。盆腔包块： 部分患者可以在盆腔触及包块。一般来说，包块大小不一，有的患者自己能感觉到下腹部有可活动的包块，但通常需要通过妇科检查或超声等辅助检查才能更准确地发现和评估包块的情况。包块是由于异位的子宫内膜在卵巢内生长，反复出血形成的囊肿所致。
三、其他相关症状
不孕： 巧克力囊肿可能会导致女性不孕。这是因为囊肿会影响卵巢的正常排卵功能，还可能影响输卵管的通畅性，或者改变盆腔内的环境，不利于受精卵的着床等。据统计，患有巧克力囊肿的女性中，约有30% - 50%存在不孕的情况。肠道或泌尿系统症状： 如果巧克力囊肿累及肠道或泌尿系统，可能会出现相应的症状。累及肠道时，可能会有腹痛、腹泻、便秘等表现；累及泌尿系统时，可能会出现尿频、尿急、尿痛甚至血尿等症状。这是因为异位的子宫内膜侵犯了肠道或泌尿系统的组织，导致相应器官的功能受到影响。