衣原体阳性主要是感染了衣原体所致。衣原体是一种微生物，可通过多种途径传播导致阳性结果。
性传播是常见原因之一
与感染者发生无保护性行为： 性传播是衣原体感染的主要途径之一。在性接触过程中，衣原体可以通过黏膜传播，比如女性的宫颈、尿道，男性的尿道等部位容易受到感染。研究显示，有多个性伴侣或者不注意性行为防护的人群，感染衣原体的风险明显升高。
母婴传播也是原因
孕妇感染后传染给胎儿： 如果孕妇感染了衣原体，在分娩过程中，胎儿经过产道时可能会被感染。例如，孕妇宫颈部位存在衣原体感染，胎儿通过产道时就有可能接触到衣原体，从而导致新生儿出现衣原体相关的感染问题，像新生儿结膜炎等可能就与母婴传播的衣原体有关。
密切接触间接传播
共用私人物品等密切接触： 虽然相对来说不是最主要的传播方式，但也存在一定风险。比如与衣原体阳性患者共用毛巾、浴盆等私人物品，在密切接触的情况下，有可能间接感染衣原体。不过这种情况感染的概率相对性传播和母婴传播要低一些，但也不能完全忽视。比如在一些卫生条件较差、多人共用生活物品的环境中，就可能发生这样的间接传播。
自身免疫力低下易感染
免疫力较弱时易被感染： 当人体自身免疫力比较低下的时候，比如长期患有慢性疾病、过度劳累、营养不良等情况，身体抵御衣原体的能力就会下降，这时候就更容易受到衣原体的侵袭而出现阳性结果。例如，长期患有糖尿病的患者，由于身体免疫力相对较低，相比免疫力正常的人，感染衣原体后更难自行清除，更容易检测出衣原体阳性。