怀孕初期总是肚子疼的原因可能包括正常生理现象、先兆流产、异位妊娠等。
一、正常生理现象：怀孕后女性体内激素水平会发生变化，雌激素和孕激素分泌增多，这可能对胃肠神经产生影响。同时，怀孕初期受精卵着床时会对子宫形成刺激，从而导致怀孕初期总是肚子疼。如果没有其他异常症状，这通常属于正常生理现象。在此情况下，女性应注意卧床休息，并且要放松自身心态。
二、先兆流产：一些因素如胚胎发育不良、药物影响、黄体功能不全等可能引发先兆流产，出现阴道少量出血以及腹痛等表现，进而造成怀孕初期总是肚子疼。此时女性需要尽快就医，一般可在医生指导下使用如黄体酮栓、保胎灵片、孕康口服液等药物进行保胎治疗。
三、异位妊娠：输卵管畸形、输卵管粘连等情况可能致使受精卵在输卵管部位受阻，不能进入子宫腔而在输卵管处着床，随着胚胎发育可能导致输卵管破裂，引起怀孕初期总是肚子疼。此时女性需要及时终止妊娠，一般可通过输卵管切除术来治疗，以避免发生大出血。
总之，怀孕初期总是肚子疼可能有多种原因，需要根据具体情况进行判断和处理。如果有相关症状，应及时就医并遵循医生的建议进行治疗或处理。