急性肠胃炎通常可使用止泻药、解痉药、微生态调节剂等药物缓解症状。一般来说，通过合理用药，多数患者能在数天内好转。
止泻药物：
蒙脱石散： 它能吸附肠道内的病毒、细菌及其产生的毒素等，对各种原因引起的腹泻都有作用。成人每次服用1袋（3克），每天3次。儿童1岁以下每日1袋，分3次服；1 - 2岁每日1 - 2袋，分3次服；2岁以上每日2 - 3袋，分3次服。黄连素： 具有一定的抑菌作用，可用于肠道感染引起的腹泻。成人一般每次口服0.1 - 0.3克，每天3次。
解痉止痛药物：
颠茄片： 能解除胃肠道平滑肌痉挛，缓解腹痛。成人常用量是一次1片，疼痛时服用，必要时可重复服用，但24小时内服用不宜超过8片。不过，前列腺肥大、青光眼患者禁用。山莨菪碱片： 也可缓解胃肠道痉挛引起的疼痛。成人每次5 - 10毫克，每天3次。脑出血急性期及青光眼患者禁用。
微生态调节剂：
双歧杆菌三联活菌胶囊： 可以调节肠道菌群，改善因肠道菌群失调引起的腹泻、腹胀等症状。成人一般一次2 - 4粒，一天2 - 3次，用温水送服。冷藏保存。枯草杆菌二联活菌颗粒： 适用于因肠道菌群失调引起的腹泻、便秘、腹胀等。儿童一次1袋，一天1 - 2次；成人一次1 - 2袋，一天1 - 2次，用40℃以下的温水或牛奶冲服，也可直接服用。
抗感染药物：
如果是细菌感染引起的急性肠胃炎，可能需要使用抗生素。比如诺氟沙星，成人一次0.2克，一天3 - 4次，但18岁以下青少年、孕妇、哺乳期妇女禁用。对于病毒感染引起的急性肠胃炎，一般不需要使用抗病毒药物，主要是对症治疗。