龟头上有小水泡可能由非感染性原因、生殖器疱疹、龟头炎等引起，治疗方法各有不同。
一、非感染性原因：
1.性生活粗暴、用力摩擦或局部清洁不足等情况会致使龟头上出现小水泡，其疼痛通常不明显，且一般可自行缓解。
二、生殖器疱疹：
1.这是由单纯疱疹病毒引发的一种性传播疾病。主要表现为龟头上、阴部或肛周出现小水泡，同时可能伴有发烧、疼痛、头痛、疲劳等症状。治疗时可在医生指导下使用药物，如盐酸伐昔洛韦片、阿昔洛韦片、泛昔洛韦片等。
三、龟头炎：
1.通常也会导致龟头上有小水泡，甚至出现糜烂、渗出和出血现象。治疗可在医生指导下使用药物，如盐酸左氧氟沙星胶囊、氟康唑胶囊、伊曲康唑胶囊等。
在治疗期间，要注意每日勤清洗生殖器，勤换内裤，避免剧烈运动。保证充足休息，避免长时间熬夜，防止过度劳累。
总之，当龟头上出现小水泡时，要及时明确原因，并根据具体情况采取合适的治疗措施，同时注意做好日常护理。