广基息肉多数是良性的，但也有少数可能为恶性。一般来说，超过80%的广基息肉属于良性病变。
如何通过外观初步判断
息肉大小： 通常直径小于1厘米的广基息肉良性的可能性相对较大。而直径大于2厘米的广基息肉，恶性的风险会有所增加。表面形态： 良性的广基息肉表面往往比较光滑。恶性的广基息肉表面可能不光滑，甚至有溃疡、结节状等改变。
通过病理检查确诊
活检方法： 医生会通过内镜下取广基息肉的组织进行病理检查，这是确诊息肉良恶性的金标准。一般在发现广基息肉后，都会建议进行病理活检。病理报告解读： 病理报告中会明确息肉的细胞类型等情况。如果病理报告显示为腺瘤性息肉等，其中部分有恶变潜能，相对恶性风险较高；而炎症性息肉等多为良性。
治疗及随访建议
良性广基息肉： 如果是良性的广基息肉，比如炎症性息肉等，较小的可以定期内镜随访观察。如果息肉较大，影响到消化道功能等情况，可在内镜下进行切除等治疗。例如直径在0.5 - 1厘米左右的良性广基息肉，可选择内镜下黏膜切除术（EMR）等。恶性广基息肉： 如果是恶性的广基息肉，需要根据具体的病情进行综合治疗，可能涉及手术、化疗、放疗等多种手段。比如早期的消化道恶性广基息肉，通过手术切除有可能达到较好的预后；而中晚期的则需要更综合的治疗方案。