宝宝三个月眼睛流眼泪、有眼屎，可能是由以下原因引起的：
1.感染：宝宝的眼睛可能被细菌、病毒或其他感染源感染，导致炎症和分泌物增多。这种情况可能伴有眼睛红肿、疼痛或瘙痒等症状。可以使用一些抗生素眼药水或眼膏来治疗感染。
2.泪囊炎：泪囊炎是由于泪道堵塞引起的。泪道是将泪液从眼睛排出的通道，如果堵塞，泪液就会积聚在眼睛里，导致感染和眼屎增多。医生可能会建议进行泪道冲洗或其他治疗来缓解症状。
3.过敏：宝宝可能对某些物质过敏，如空气中的花粉、尘螨或食物等，导致眼睛过敏和炎症。这种情况下，宝宝的眼睛可能会红肿、流泪和有眼屎。可以使用抗过敏眼药水来缓解症状。
4.先天性泪道狭窄或闭锁：这种情况比较罕见，但也可能导致宝宝眼睛流眼泪和有眼屎。医生可能会进行进一步的检查和治疗，如泪道探通术等。
5.其他原因：宝宝的眼睛可能还会因为其他原因而流眼泪和有眼屎，如倒睫、眼睑内翻等。
如果宝宝出现眼睛流眼泪和有眼屎的情况，建议及时就医，以便确定具体原因并得到适当的治疗。同时，家长应该注意保持宝宝的眼部清洁，每天用温水清洗宝宝的眼睛，避免用手揉搓眼睛，以免加重感染。如果医生建议使用眼药水或眼膏，应按照医嘱正确使用。如果宝宝的症状持续不缓解或加重，应及时复诊。