贲门失弛缓症的治疗方式需根据病情严重程度等因素选择，一般可以通过内镜治疗、手术治疗等方式。轻度患者可先尝试内镜下球囊扩张或肉毒杆菌毒素注射等方法，比如内镜下球囊扩张通常能在一定程度上缓解症状，但可能需要多次治疗。
内镜下治疗方式
球囊扩张： 通过内镜将球囊置于食管与胃连接的贲门部位，然后扩张球囊，撑开狭窄的贲门。一般每次扩张可能需要几分钟，能暂时缓解吞咽困难等症状，但部分患者可能复发。肉毒杆菌毒素注射： 将肉毒杆菌毒素注射到食管下括约肌处，阻断神经冲动传递，使括约肌松弛。通常注射后数天到几周内起效，不过效果维持时间有限，可能几个月后需要再次注射。
手术治疗方法
Heller肌层切开术： 这是传统的手术方式，通过切开食管下括约肌的肌层，解除括约肌的痉挛和狭窄。手术一般需要在全身麻醉下进行，术后能有效改善吞咽困难，但可能会有一些并发症，如反流性食管炎等，发生率约在10%~20%左右。腹腔镜下Heller肌层切开术： 属于微创手术，相对于传统手术创伤更小，恢复更快。通过几个小切口插入腹腔镜器械进行操作，术后患者疼痛较轻，住院时间较短，一般术后1~2天即可下床活动，1周左右可出院。
药物辅助治疗
硝酸酯类药物： 如硝酸甘油等，能松弛食管下括约肌，缓解吞咽困难症状，但效果相对有限，且可能有头痛等副作用。一般是在其他治疗方法效果不佳时短期使用。钙通道阻滞剂： 像硝苯地平，也可以起到一定松弛食管下括约肌的作用，从而改善吞咽困难，但同样存在个体差异，部分患者使用后效果不明显，且可能有低血压等不良反应。