胆固醇在机体内有着重要作用，若总胆固醇低，则会对胆汁酸合成、激素合成与维生素D3的合成、细胞膜更新等产生影响。
一、胆汁酸合成方面。胆汁酸是人体内胆固醇代谢的主要途径，其能参与人体脂肪的消化吸收，大部分胆汁酸可通过肠肝循环重复利用，而小部分会被排出体外，所以需要胆固醇转化成胆汁酸来填补这部分的缺失，一旦总胆固醇含量低，就会影响胆汁酸的生成，进而导致消化功能出现障碍。
二、激素合成与维生素D3合成方面。胆固醇是肾上腺皮质、睾丸、卵巢等合成类固醇激素的原料，比如醛固酮、皮质醇、雄激素、雌激素等，缺少这些激素会引发内分泌功能紊乱、免疫力降低等状况。同时，胆固醇还能参与维生素D3的转化，而维生素D3可促进机体对钙的吸收，缺乏胆固醇就会使机体对钙的吸收受到影响。
三、细胞膜更新方面。胆固醇是细胞膜的重要组成部分，若缺乏胆固醇，会对细胞的生理功能产生不利影响。
总之，胆固醇在机体中发挥着多方面的关键作用，总胆固醇水平的高低会对诸多生理过程产生重要影响。