龟头炎的治疗药物需根据不同病因选择，一般细菌感染引起的龟头炎，常用莫匹罗星软膏等抗生素类药物。比如细菌性龟头炎，使用莫匹罗星软膏可能有较好效果，通常用药后几天内症状会有所改善。
细菌性龟头炎用药
莫匹罗星软膏： 属于外用抗生素，能抑制细菌蛋白质合成，从而发挥杀菌作用，可用于细菌感染导致的龟头炎。红霉素软膏： 对革兰阳性菌有较强抗菌作用，也可用于细菌性龟头炎的治疗，能减轻炎症、缓解症状。
念珠菌性龟头炎用药
克霉唑乳膏： 是抗真菌药物，通过抑制真菌细胞膜的合成来发挥抗真菌作用，适用于念珠菌感染引起的龟头炎。咪康唑乳膏： 同样为抗真菌药，对念珠菌有良好的抗菌活性，能有效改善念珠菌性龟头炎的症状。
滴虫性龟头炎用药
甲硝唑： 是治疗滴虫感染的常用药物，对于滴虫性龟头炎有一定疗效。不过要注意，儿童一般不推荐使用甲硝唑，需在医生评估后谨慎选择。在治疗龟头炎用药时，要注意保持局部清洁卫生，避免搔抓。如果是已婚患者，配偶有阴道炎时应同时进行治疗。而且用药前最好先明确龟头炎的具体病因，若是细菌、真菌还是滴虫等感染，以便针对性用药。同时，使用药物时要遵循医生的指导，不要自行随意用药，特别是一些特殊人群，如孕妇、儿童等，更要谨慎选择药物。