大便过后肛门疼痛可能由以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型症状为肛门疼痛、便血和便秘。肛门视诊可发现肛裂“三联征”，即肛裂、前哨痔和肛乳头肥大。
2.外痔：肛缘皮肤皱襞突起，如水泡样，颜色青紫，大便时可变大，一般无明显症状，偶尔会有肿胀、疼痛。
3.内痔：通常无明显疼痛，有时仅感觉肛门部坠胀或排便困难。若内痔被感染、嵌顿、出现绞窄性坏死，则会导致剧烈的疼痛。
4.肛管及直肠炎症：肛管炎、肛窦炎、直肠炎等均可引起肛门疼痛。
5.肛门脓肿或肛瘘：肛门周围脓肿会引起肛门疼痛，脓液破溃后可形成肛瘘，也会出现疼痛、瘙痒等症状。
6.其他：肛门直肠神经官能症、耻骨直肠肌综合征等也可能导致肛门疼痛。
如果出现大便过后肛门疼痛的症状，建议及时就医，明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，应注意保持肛门清洁，避免食用辛辣刺激性食物，预防便秘。