大便过后肛门疼痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，是一种常见的肛管疾病。好发于青壮年，儿童也可发生，老年人较少见。肛裂最常见的部位是肛门的前后正中，以前正中为多。典型的肛裂其疼痛具有以下特点：①疼痛的程度非常剧烈，难以忍受；②疼痛具有周期性，多在大便时或大便后发生；③疼痛常持续数小时，甚至一天。
2.外痔：外痔位于齿线以下，是由痔外静脉丛曲张或肛缘皱襞皮肤发炎、肥大、结缔组织增生或血栓瘀滞而形成的肿块。外痔表面盖以皮肤，可以看见，不能送入肛内，不易出血，以疼痛和有异物感为主要症状。临床常分为结缔组织外痔、静脉曲张性外痔、炎性外痔和血栓外痔。
3.肛管直肠周围脓肿：是肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿，其特点是自行破溃，或在手术切开引流后常形成肛瘘。是常见的肛管直肠疾病，也是肛管、直肠炎症病理过程的急性期，肛瘘是慢性期。常见的致病菌有大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌和绿脓杆菌，偶有厌氧性细菌和结核杆菌，常是多种病菌混合感染，肛门周围皮下脓肿最常见。
4.内痔嵌顿：内痔或混合痔脱出、嵌顿，未能及时复位，导致肛管皮下血管破裂、血液淤积、血栓形成，从而并发感染、水肿、疼痛。
5.其他：肛门直肠手术后并发感染、直肠炎、肛窦炎、血栓外痔、肛管直肠癌等，也会出现肛门疼痛的症状。
总之，大便过后肛门疼痛可能是一种严重的疾病的症状，也可能是一种轻微的不适。如果你经常出现这种情况，建议你及时就医，以便明确诊断并得到适当的治疗。