脚趾缝发痒、脱皮、起水疱可能由多种原因引起，具体如下：
一、足癣：这通常是由皮肤真菌引发的足部真菌感染。其症状表现为脚趾缝出现水疱、脱皮，且伴有瘙痒。治疗方面，可在医生指导下使用以下药物：
1.复方酮康唑软膏；
2.盐酸特比萘芬凝胶；
3.口服伊曲康唑胶囊。
二、接触性皮炎：是一种因皮肤接触外部物质而导致的疾病，能发生在身体所有表面部位。治疗时可遵医嘱使用如下药物：
1.曲安奈德益康唑乳膏；
2.复方醋酸地塞米松乳膏；
3.口服甲泼尼龙片。同时要适当进行体育锻炼以提高自身抵抗力。
三、汗疱疹：属于湿疹的一种，可能与精神紧张、真菌感染等因素有关，会有相应症状表现。治疗可采用以下药物：
1.硝酸咪康唑乳膏；
2.复方聚维酮碘搽剂；
3.足光散。平时要注意饮食清淡，保证膳食平衡。
此外，还有可能是过敏导致，患者需及时就诊并进行相应处理。
总之，当出现脚趾缝发痒、脱皮、起水疱等症状时，应及时就医明确病因，并根据具体病因进行针对性治疗。