生化妊娠和自然流产存在以下区别：
一、定义不同：
1.生化妊娠指血HCG值一过性增高后很快下降，主要是受精卵着床失败导致，B超检查未发现孕囊，即受精卵未成功着床。
2.自然流产是在妊娠28周之前，受精卵已成功着床，B超可发现孕囊，但最终妊娠结局为流产，且根据宫内妊娠物是否自行完全排出，分为不完全流产和完全流产。
二、症状不同：
1.生化妊娠通常无明显临床症状，仅表现为月经量增多或月经稍延迟，常被当作月经而被忽视。
2.自然流产有明显停经史，停经后可能出现阴道不规则出血，伴有腹痛、妊娠物排出等。
三、治疗方案不同：
1.生化妊娠发生时一般无需特殊治疗，多数生化妊娠为偶发性，不影响生育功能。
2.自然流产需根据具体情况采取措施，完全流产通常无需特殊治疗，不完全流产则需药物治疗如遵医嘱服用米非司酮、米索前列醇以促使胚胎及组织物排出宫腔，或进行清宫手术，即在B超引导下清理出宫腔内孕囊。
总之，生化妊娠和自然流产在定义、症状和治疗方案上都有不同，需要准确区分并采取合适的应对措施。