疱疹性咽峡炎是由肠道病毒引起的以急性发热和咽峡部疱疹、溃疡为特征的疾病，治疗药物需根据症状来选。一般来说，对症用药缓解不适，如发热时可使用退烧药等。
对症治疗药物
退热药物：如果患者体温超过38.5℃，可以使用对乙酰氨基酚来退热，它适用于儿童和成人，能通过抑制前列腺素合成发挥退热作用。抗病毒药物：目前对于肠道病毒感染引起的疱疹性咽峡炎，尚无特效抗病毒药物，不过利巴韦林气雾剂可用于局部抗病毒，但要注意其可能存在的不良反应。
局部用药缓解疼痛
含漱液：可以使用淡盐水含漱，能起到一定清洁口腔、减轻咽部不适的作用。一般每次含漱10 - 15毫升淡盐水，每天可含漱3 - 4次。喷剂：如西瓜霜喷剂，能起到消肿止痛、促进疱疹愈合的作用，直接喷于咽部患处即可。
护理相关注意事项
饮食方面：患病期间要给患者提供清淡、易消化的食物，比如米粥、面条等，避免食用辛辣、刺激性食物，以免加重咽部疼痛。休息方面：患者需要多休息，保证充足的睡眠，一般每天睡眠时间要达到10 - 12小时左右，有助于身体恢复。
特殊人群用药提醒
儿童患者：儿童使用退热药物时要注意剂量，需根据体重精确计算。比如对乙酰氨基酚，按体重每次10 - 15毫克/千克。而且儿童使用抗病毒药物更要谨慎，必须在医生指导下进行。孕妇患者：孕妇患疱疹性咽峡炎时，用药需格外小心，退热药物和抗病毒药物的选择都要经过医生评估，因为某些药物可能会对胎儿产生影响，要优先选择对胎儿无影响或影响较小的治疗方式。