三个月宝宝全身偏软的原因主要有以下几点：
1.正常的生理现象：三个月的宝宝，其骨骼和肌肉发育还不完善，所以会出现全身偏软的情况，这是正常的生理现象，随着宝宝的生长发育，这种情况会逐渐改善。
2.营养不良：如果宝宝摄入的营养不足，会导致身体虚弱，出现全身偏软的情况。
3.缺乏锻炼：如果宝宝长期缺乏锻炼，会导致肌肉无力，出现全身偏软的情况。
4.疾病：某些疾病也可能导致宝宝全身偏软，如脑瘫、肌肉萎缩症等。如果宝宝出现全身偏软的情况，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定具体的原因，并采取相应的治疗措施。