克隆恩氏病是一种慢性炎症性肠道疾病，其临床表现多样。一般来说，克隆恩氏病可累及从口腔到肛门的整个消化道，患者常出现消化道相关症状以及全身症状等。
消化道症状表现
腹痛： 多位于右下腹或脐周，呈间歇性发作，疼痛性质多样，可为痉挛性痛，也可表现为钝痛。约有70% - 80%的患者会出现腹痛症状，疼痛程度不一，部分患者疼痛较为剧烈，影响日常生活。腹泻： 也是常见症状之一，大便多为糊状，一般无脓血和黏液。腹泻频率因人而异，轻者每日2 - 3次，重者可达每日10余次。有些患者可能会出现腹泻与便秘交替的情况，这是因为病变部位的肠道功能紊乱导致。
全身症状表现
发热： 部分患者会出现发热症状，多为间歇性低热或中度发热，少数患者可出现高热。发热一般是由于肠道炎症反应引起的全身性炎症表现，约有40%左右的患者会有不同程度的发热情况。营养不良： 由于肠道吸收功能受到影响，患者可能会出现营养不良的表现，如体重下降、消瘦、贫血等。长期患病的患者，体重可能会在数月内下降10%以上，同时还可能伴有低蛋白血症等情况，影响身体的正常机能。
肠道外表现
口腔病变： 约有10% - 20%的患者会出现口腔病变，如口腔溃疡、牙龈增生等。口腔溃疡可反复发作，给患者带来疼痛，影响进食。关节症状： 部分患者会有关节疼痛、肿胀等症状，以大关节受累较为常见，如膝关节、踝关节等。关节症状可能与肠道炎症的免疫反应有关，在肠道炎症活动期时，关节症状也可能会加重。皮肤表现： 少数患者会出现皮肤病变，如结节性红斑、坏疽性脓皮病等。结节性红斑表现为下肢伸侧的红色结节，伴有疼痛；坏疽性脓皮病则会出现皮肤溃疡等严重表现，给患者皮肤健康带来损害。