男性支原体感染后，不同部位感染症状有所不同。泌尿生殖道感染时，约1-3周会出现症状，常见尿道刺痛，还可能有不同程度的尿急、尿频，尿道口轻度红肿，分泌物稀薄、量少，为浆液性或脓性，部分患者晨起有“糊口”现象。
泌尿生殖道感染表现
尿道不适：除了尿道刺痛，还可能感觉尿道瘙痒，尤其在排尿时可能有明显的不适感。分泌物情况：有的患者尿道分泌物量少，颜色可能偏黄，在长时间不排尿后，分泌物会更明显地附着在尿道口。
呼吸道感染表现
如果是支原体引起的呼吸道感染，一般潜伏期2-3周，起病较缓慢。初期可能有乏力、头痛等全身症状，接着会出现咳嗽，多为刺激性干咳，可持续较长时间，有时咳嗽较为剧烈，影响日常生活和休息，一般没有明显的咳痰，或者仅有少量白色黏液痰。
其他可能表现
部分男性支原体感染后，可能没有明显的局部症状，但通过检查能发现支原体存在。还有些人可能会伴有发热，体温一般在38℃左右，也有少数人会出现高热情况。而且，支原体感染还有可能引起附睾炎等并发症，此时会出现阴囊部位疼痛、肿胀等症状。