胃肠紊乱时用药需根据具体症状来选。比如出现消化不良、腹胀等症状，可使用促胃肠动力药，像多潘立酮能促进胃肠道蠕动，一般可缓解因胃肠功能紊乱导致的消化不良情况。
调节胃肠动力类药物
多潘立酮： 能直接作用于胃肠壁，增加胃肠道的蠕动和张力，促进胃排空，从而缓解胃肠紊乱引起的腹胀、恶心、呕吐等症状。但孕妇慎用，哺乳期妇女使用时应停止哺乳。莫沙必利： 可促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠道运动，改善功能性消化不良、胃肠功能紊乱引起的相关症状。老年人使用时需注意观察，如有不适及时就医。
调节肠道菌群类药物
双歧杆菌四联活菌片： 含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等四种有益菌，能补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，改善因胃肠紊乱导致的腹泻、便秘等情况。婴幼儿服用时可将药片碾碎后用温水送服。地衣芽孢杆菌活菌胶囊： 以活菌进入肠道后，对葡萄球菌、酵母样菌等致病菌有拮抗作用，而对双歧杆菌、乳酸杆菌、拟杆菌、消化链球菌有促进生长作用，从而调整肠道菌群失调，改善胃肠功能紊乱。儿童服用时需在成人监护下进行。
抑制胃酸分泌类药物
奥美拉唑： 属于质子泵抑制剂，能特异性地抑制胃壁细胞质子泵的活性，减少胃酸分泌，对于胃肠紊乱伴有胃酸过多引起的胃痛、反酸等症状有较好的缓解作用。严重肾功能不全者及婴幼儿禁用。雷贝拉唑： 通过抑制胃酸分泌来减轻胃酸对胃肠黏膜的刺激，适用于胃肠功能紊乱导致的胃酸相关不适。肝肾功能不全者需调整剂量。