女性衣原体感染主要是由沙眼衣原体引起的。据相关医学研究，性传播是女性衣原体感染的主要病因之一。在性活跃期的女性中，通过无保护措施的性行为，如与感染衣原体的性伴侣发生性行为，感染风险较高。
性传播途径方面
与感染源直接接触： 当女性与携带沙眼衣原体的性伴侣进行阴道性交、肛交或口交等性行为时，沙眼衣原体很容易传播到女性的生殖道等部位引发感染。例如，有研究表明，在性伴侣感染衣原体的情况下，女性一次性接触感染的概率相对较高。多个性伴侣影响： 拥有多个性伴侣的女性，感染衣原体的几率明显高于性伴侣单一的女性。因为接触感染源的机会增多，增加了病原体侵入的可能性。
母婴传播途径方面
分娩过程中的感染： 孕妇如果感染了衣原体，在分娩过程中，胎儿通过产道时可能会被感染。据统计，约有50%左右的新生儿会在通过感染衣原体母亲的产道时被感染，引发新生儿眼炎或肺炎等疾病。围产期的感染风险： 即使孕妇在孕期通过治疗衣原体感染，分娩时仍有一定概率将病原体传给新生儿，所以孕期的规范检查和感染控制很重要。
间接接触传播方面
共用卫生洁具等情况： 虽然间接接触传播的概率相对较低，但如果女性与感染者共用毛巾、浴盆等卫生洁具，在卫生洁具上残留有沙眼衣原体的情况下，也有可能导致感染。不过这种情况一般是在卫生洁具被病原体污染且女性皮肤或黏膜有微小破损时才容易发生。公共场所卫生影响： 在一些公共浴室、温泉等场所，如果卫生条件不佳，卫生洁具被衣原体污染，健康女性接触后也存在一定的感染风险，但相比性传播和母婴传播，这种情况发生的比例较小。