小孩子发烧肚子痛可能由多种原因引起，比如常见的急性上呼吸道感染伴发胃肠功能紊乱，这种情况在儿童中较为多见，约有20%左右的上呼吸道感染患儿会同时出现胃肠不适症状。
一、感染性因素
1. 肠道病毒感染：
轮状病毒感染：多发生在秋冬季节，除了发烧、肚子痛，还会出现频繁呕吐、水样便。孩子可能在1 - 3天内体温升高到38℃ - 39℃甚至更高，肚子痛以脐周为主，疼痛程度不等。细菌性痢疾：由痢疾杆菌引起，孩子会有发热，多为低热或中等度热，同时肚子痛较明显，以左下腹为主，还会伴有黏液脓血便，每天排便次数可达十余次甚至更多。
2. 呼吸道感染波及胃肠道：
比如孩子患了急性扁桃体炎，细菌产生的毒素可能影响胃肠道功能，导致孩子发烧，体温可达38.5℃以上，同时出现肚子痛，疼痛一般不太剧烈，呈隐痛。
二、非感染性因素
1. 胃肠功能紊乱：
孩子饮食不规律，比如吃了过多零食、生冷食物等，容易引起胃肠功能紊乱。会出现发烧，体温多在37.5℃ - 38.5℃之间，肚子痛为阵发性，疼痛部位不固定，可能是整个腹部都有不适感。
2. 外科急腹症早期表现：
急性阑尾炎：初期可能先有发烧，体温在38℃左右，随后出现肚子痛，刚开始是脐周疼痛，数小时后转移并固定在右下腹，肚子痛逐渐加剧。肠套叠：多见于2岁以内婴幼儿，孩子会突发剧烈阵发性腹痛，伴有哭闹不安，同时有呕吐，之后出现果酱样大便，也会有发热情况，体温一般在38℃左右。