怀孕两个月腰疼，主要与以下原因有关：一是激素水平变化，二是子宫韧带拉长，三是缺钙。
一、激素水平变化：在怀孕两个月的孕早期阶段，孕妇体内的雌激素和孕激素水平会有显著改变。受此影响，会导致关节韧带松弛，使得盆腔组织与神经受到压迫，从而引发较为明显的腰痛症状。
二、子宫韧带拉长：怀孕两个月时，子宫已经开始增大，其周围的韧带也会随之拉长，这种韧带的变化就会引起腰痛现象。
三、缺钙：怀孕后，随着胎儿的逐步发育成长，胎儿所需的营养物质越来越多。如果平时没有注意均衡膳食、合理补充营养，那么很容易在怀孕两个来月时就出现缺钙情况。当机体缺钙后，容易诱发骨质疏松，进而导致腰痛表现。
如果怀孕两个月腰疼的情况比较严重，应及时就医，经明确诊断后由医生指导进行对症处理。
总之，怀孕两个月腰疼可能由多种原因引起，当腰疼严重时要及时寻求专业帮助。