龟头隐隐作痛，可能由龟头炎、尿道炎、尿道结石等因素引起。
一、龟头炎：
龟头炎即龟头黏膜出现的炎症，其成因多样，包括感染、局部刺激等。通常会表现为龟头充血、肿胀以及隐隐作痛等症状。针对龟头炎的治疗，患者可使用依沙吖啶溶液、复方氯己定溶液等抗炎溶液。若龟头炎是由包皮过长所致，那么患者还需接受包皮环切手术。
二、尿道炎：
尿道炎是因细菌或病毒感染引发的尿道炎症，主要症状有尿道痒、尿痛、龟头隐隐疼痛等。如果是细菌感染导致的尿道炎，患者可运用环丙沙星、左氧氟沙星等抗生素药物进行治疗；若是病毒感染引起的尿道炎，则可使用更昔洛韦、阿昔洛韦等抗病毒药物来医治。
三、尿道结石：
尿道结石是肾和膀胱中形成的结石排入并停留在尿道所造成的，它会刺激并损伤尿道黏膜，进而引发排尿困难、龟头隐隐作痛、血尿等症状。患者可以通过尿道外口切开取石手术来进行治疗。
总之，当龟头出现隐隐作痛的情况时，应考虑可能是上述疾病所致，需及时就医，明确病因后进行针对性的治疗。