屁股两边肌肉酸痛可能由生理性因素引起，也可能是一些病理性因素导致，患者需及时就医，明确原因后针对性治疗，以防病情延误。以下是具体情况：
一、生理性因素：
1.运动过度、长时间久坐等情况，都可能使臀部、骶尾部筋膜和肌肉过度受力，引发肌肉痉挛或劳损，主要表现为臀部两侧肌肉酸胀、疼痛等。可通过按摩缓解，也可遵医嘱服用布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚等解热镇痛药。
二、病理性因素：
1.腰椎间盘突出症：这是由于椎间盘退行性变、纤维环破裂，髓核组织突出刺激和压迫马尾神经或神经根而引起的临床综合征。常从臀部疼痛开始，沿大腿后面、小腿外侧至脚背出现放射性疼痛，从而导致臀部上两侧肌肉酸痛。可遵医嘱服用甲钴胺、神经生长因子等营养神经药物，必要时需手术治疗改善。
2.双侧骶髂关节炎：指骶髂关节的炎症反应，分原发性和继发性，严重程度与关节磨损程度及自身病情发展有关。轻者仅有腰臀部疼痛，重者可致关节磨损严重、活动障碍等。双侧骶髂关节炎会出现无菌性炎症反应，造成关节僵硬、双侧臀部疼痛，主要表现为臀部上两侧肌肉酸胀、疼痛。可遵医嘱服用尼美舒利分散片、塞来昔布胶囊等非甾体抗炎药，以减轻局部炎症，缓解疼痛。
此外，还可能是坐骨神经炎、髋关节或骨盆骨折等引起，应及时到医院完善相关检查，明确原因后针对性治疗。
总之，当出现屁股两边肌肉酸痛时，要综合考虑各种可能因素，及时进行准确诊断和恰当治疗。