月经不调的原因有多种。一般来说，内分泌失调是常见原因之一，比如多囊卵巢综合征，约占育龄女性月经不调病因的15% - 20%。
内分泌失调方面
激素水平失衡： 下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能出现紊乱，会导致雌激素、孕激素等分泌异常。比如长期压力大、熬夜等，可能影响下丘脑分泌促性腺激素释放激素，进而使垂体分泌的促卵泡生成素、促黄体生成素失衡，引起月经不调。甲状腺功能异常： 甲状腺分泌的甲状腺素如果过多或过少，也会干扰月经。甲状腺功能亢进时，可能出现月经稀少、闭经；甲状腺功能减退时，可能表现为月经过多、经期延长。
妇科疾病影响
子宫肌瘤： 这是女性常见的良性肿瘤，当肌瘤较大或生长位置特殊时，会影响子宫的收缩和内膜的正常脱落，导致月经周期缩短、经期延长、经量增多等。例如，黏膜下子宫肌瘤对月经的影响较为明显。子宫内膜异位症： 子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位，会引起盆腔粘连、卵巢功能异常等，导致痛经、月经不调，有的女性还会出现经量增多、经期延长的情况。
生活方式因素
过度节食： 有些女性为了减肥过度节食，导致身体摄入的营养不足，尤其是蛋白质、脂肪等缺乏，会影响雌激素的合成，从而出现月经不调。一般体重下降10% - 15%就可能影响月经。吸烟酗酒： 烟草中的尼古丁和酒类中的酒精会干扰月经调节的神经内分泌系统，增加月经不调的发生几率。长期吸烟的女性，月经紊乱的风险比不吸烟的高。