睡着时突然心跳剧烈跳动醒了，可能是心律失常、窦性心动过速、冠心病等情况，或是严重感染导致体温升高、心率加快引起。应针对不同病因进行治疗。具体如下：
一、心律失常
1.房室折返型心动过速或房室结折返型心动过速，以及快速房颤等，都可能在夜间睡眠时突然发作，发作时心跳很快，心率每分钟可达150次以上，患者会有心慌、心悸症状而在睡眠中醒来。这类患者可按医嘱通过静脉注射胺碘酮缓解症状，必要时还可采用同步直流电复律的方式治疗，若要根治则需进行射频消融手术。
二、窦性心动过速
在清醒状态下因休息不好、劳累压力大、精神紧张、熬夜等使交感神经兴奋性异常，睡眠期间交感神经兴奋性未完全恢复正常，从而导致心跳加快，出现窦性心动过速，致使难以入睡或睡眠中突然醒来。患者可遵医嘱应用美托洛尔等β-受体阻滞剂进行治疗。同时建议患者平时缓解压力、规律作息，以控制交感神经兴奋性异常，减少睡眠期间窦性心动过速发生。
三、冠心病
患者睡眠时冠心病发作引起心肌缺血，会导致心跳过速并突然醒来。可遵医嘱用硝酸甘油等硝酸酯类药物扩张冠状动脉以改善心肌缺血，还可考虑用阿司匹林等抗凝血药物减少血栓形成。此外，患者长期服用瑞舒伐他汀等他汀类药物，可改善动脉粥样硬化从而缓解症状。
四、感染
严重感染患者也可能在睡眠中因心脏剧烈跳动而醒来，因为感染会导致体温升高从而使心率加快，心率过快会使人在睡眠中突然醒来。建议积极控制感染，若是细菌感染，可根据药敏试验遵医嘱选择抗生素治疗，常用的有阿莫西林、左氧氟沙星、头孢哌酮、多西环素等；若是病毒感染，可选择应用利巴韦林等抗病毒药物进行治疗，以尽可能减少感染对人体的影响。
总结：睡着时心跳异常跳动醒来可能有多种病因，明确具体原因后采取针对性的治疗方法至关重要。患者应遵循医嘱进行治疗和调理。