吃黄体酮五天后有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.药物副作用：服用黄体酮后，可能会出现突破性出血、阴道点状出血、体重增加或减少、宫颈鳞柱交界改变、宫颈分泌物性状改变、乳房肿胀、恶心、头晕、头痛、倦怠感、发热、失眠、过敏伴或不伴瘙痒等不良反应。突破性出血和阴道点状出血一般发生在突破性出血，通常发生在漏服药之后，也可能发生在剂量调整后。
2.停药反应：一般在停药后3-7天可能会发生撤药性出血，表现为阴道褐色分泌物。
3.其他：如宫颈息肉、子宫内膜息肉、子宫内膜炎、子宫肌瘤等，也可能导致阴道褐色分泌物。
如果出现褐色分泌物，建议及时就医，进行相关检查，如B超、性激素六项等，以明确原因，并在医生的指导下进行相应的治疗。同时，在服用黄体酮期间，应遵医嘱按时服药，不要随意停药或增减剂量。此外，还应注意个人卫生，保持外阴清洁，避免过度劳累和剧烈运动。