巧克力囊肿通常不会自行消失，需借助药物或手术等方式来医治。巧克力囊肿是子宫内膜异位到卵巢内生长而形成的囊肿，其病因尚未完全明确，可能与经血逆流、淋巴及静脉扩散、遗传等有关，避孕措施、环境因素等也是诱发本病的高危因素。巧克力囊肿患者的主要症状表现为疼痛、月经异常以及不孕，该病症一般不具备自愈性，所以不会自行消失。
一、药物治疗：巧克力囊肿患者一般可在医生指导下服用醋酸甲羟孕酮片、醋酸甲地孕酮片、米非司酮片等药物。
1.醋酸甲羟孕酮片：可用于调节激素水平，对巧克力囊肿有一定的治疗作用。
2.醋酸甲地孕酮片：能起到抑制病情发展的效果。
3.米非司酮片：有助于改善病症。
二、手术治疗：也可考虑进行腹腔镜手术。
通过积极治疗，通常可以实现治愈。在日常生活中，患者要养成良好习惯，保持自身清洁卫生，饮食上不可过多食用过咸或过辣食物，可多吃些富含高蛋白和维生素的食物，同时还可以适度进行运动。
总之，对于巧克力囊肿，要重视治疗和日常护理，以促进康复。