滴虫性阴道炎主要通过药物治疗，常用药物为硝基咪唑类药物，一般7天为一个疗程。
药物治疗首选
甲硝唑： 是治疗滴虫性阴道炎的常用药物，它可以抑制滴虫的生长繁殖，达到杀灭滴虫的目的。一般采用口服给药的方式。替硝唑： 也属于硝基咪唑类药物，同样对滴虫有较好的抑制和杀灭作用，疗效与甲硝唑相当，也可以口服。
性伴侣的处理
同时治疗： 滴虫性阴道炎主要通过性传播，所以性伴侣需要同时接受治疗。如果性伴侣不进行治疗，即使患者治愈了，也容易再次被感染，导致病情反复。性伴侣也要使用硝基咪唑类药物进行治疗，方法与患者相似。避免无保护性行为： 在治疗期间以及治愈后的一段时间内，男女双方都应避免无保护的性行为，以防交叉感染。
日常注意事项
保持外阴清洁： 每天用清水清洗外阴，保持外阴的清洁干燥，但是要注意不要过度清洗阴道，以免破坏阴道的正常菌群。清洗外阴的毛巾和盆要专人专用，避免交叉感染。内裤处理： 患者的内裤要单独清洗，并且用开水烫洗，然后在阳光下暴晒，这样可以杀死可能残留的滴虫。