真菌感染的症状因感染部位不同而有所差异。比如皮肤真菌感染，常见的体癣，会出现圆形或椭圆形的红斑，边缘有丘疹、水疱，伴有瘙痒，通常面积可能从几厘米到几十厘米不等。
皮肤真菌感染症状
皮肤红斑水疱： 像手癣，初期手部可能出现小水疱，接着水疱干涸后脱屑，皮肤变得粗糙、增厚，有时还会有瘙痒感。而足癣，也就是脚气，常见脚底、脚趾间出现水疱、糜烂、脱屑等情况，严重时会有渗液、异味。皮肤增厚脱屑： 甲真菌病会让指甲变色、增厚、变形，指甲可能变得浑浊、易碎，表面凹凸不平。比如手指甲可能从边缘开始变色，逐渐累及整个指甲。
深部真菌感染症状
肺部真菌感染： 患者可能有咳嗽、咳痰，痰的性状多样，有的是白色黏痰，有的可能带有血丝。还可能伴有发热，体温一般在38℃左右，严重时会持续高热。另外，可能会有胸闷、气短等呼吸不畅的表现。消化道真菌感染： 会出现食欲不振、恶心、呕吐等症状，呕吐物可能是胃内容物。还可能有腹痛、腹泻，腹泻次数不等，轻者一天几次，重者十几次，大便可能呈稀水样或带有黏液。
黏膜真菌感染症状
口腔真菌感染： 最常见的是鹅口疮，婴幼儿多见，口腔黏膜上会出现白色斑膜，像凝乳状，不容易擦去，强行擦去后会有潮红的创面。成人也可能发生，比如佩戴假牙的人，假牙接触的黏膜部位容易出现白色斑块。阴道真菌感染： 会有阴道瘙痒，瘙痒程度轻重不一，有的非常剧烈。同时阴道分泌物增多，呈白色豆腐渣样，还可能伴有阴道灼痛，性生活时也会有疼痛感觉。