风湿关节炎的病因较为复杂，目前认为遗传因素是其中一个重要方面，约60%~70%的风湿关节炎患者有遗传易感性，携带特定的人类白细胞抗原（HLA）等基因。
遗传因素影响
基因关联： 研究发现，某些基因变异会增加患风湿关节炎的风险。比如HLA - DR4等基因与风湿关节炎的发病密切相关。携带这些基因的人群，相对其他人更容易患上风湿关节炎，但这并不意味着携带就一定会发病，只是发病几率相对增高。
感染因素作用
细菌感染： 一些细菌感染可能触发风湿关节炎。例如，A组链球菌感染可能与风湿关节炎的发病有关。当人体感染A组链球菌后，免疫系统可能会出现异常反应，错误地攻击自身组织，从而引发关节的炎症反应。病毒感染： 某些病毒感染也可能与风湿关节炎发病相关。像EB病毒等，虽然具体机制还在研究中，但有证据表明病毒感染可能会影响免疫系统的平衡，导致关节出现炎症损伤。
免疫异常机制
自身抗体产生： 风湿关节炎患者体内会产生多种自身抗体，比如类风湿因子（RF）等。这些自身抗体攻击自身的关节滑膜等组织，导致滑膜出现炎症、增生等病变，进而引起关节疼痛、肿胀、畸形等一系列症状。免疫细胞失调： 免疫系统中的T细胞、B细胞等免疫细胞功能失调也参与了风湿关节炎的发病。正常情况下，免疫细胞能维持机体的免疫平衡，但在风湿关节炎患者体内，这些免疫细胞的功能出现紊乱，导致过度的免疫反应，损伤关节组织。