牙髓炎在做根管治疗过程中出现疼痛，多因根管制备导致。正常来说牙髓神经破坏后不应牙疼，若第二次后疼痛则为非正常现象，原因可能如下：
一、根管治疗后患牙有轻微咬合痛属正常，可暂停用患齿，保持口腔卫生并继续观察。
1.这是因为治疗后可能会有一定的反应，轻微咬合痛在可接受范围内。
2.通过暂停使用患齿，能减少对其刺激，有利于恢复。
3.保持口腔卫生可防止其他感染影响恢复进程。
二、若出现发热且局部肿痛加重，可能是在根管第二次治疗时将感染物质推到牙槽骨致局部感染、压力升高。此时需到医院就诊，可口服抗感染药物，严重者需取出根管内填塞药物并进行局部清创处理。
1.这种情况较为严重，说明感染出现扩散。
2.医院就诊能进行专业处理，包括用药和必要的清创。
三、若仅局部肿胀、轻微疼痛，无明显炎症反应，可能是根管治疗时超出根管狭窄部分损伤局部血管致出血后压力升高，或操作中损伤周围牙龈、口腔黏膜等人为因素所致，此类情况一般可自行好转。
1.这种轻微症状可能是治疗过程中的一些附带情况引起。
2.其有自行恢复的可能，可先观察。
总之，在根管治疗中若出现疼痛要根据具体症状来判断原因，并采取相应的措施，必要时需及时就医处理。