宝宝喉咙长疱疹且反复发烧，很可能是手足口病或疱疹性咽峡炎导致。具体如下：
一、手足口病：这通常由肠道病毒引起。宝宝表现为喉咙有疱疹、反复发烧，还常伴有咳嗽、流鼻涕、食欲不振等症状。
1.若宝宝体温超过38.5℃，可先采用温水擦浴、使用退热贴等物理降温方法。
2.在医生指导下使用干扰素进行雾化治疗。因目前无确切抗病毒药物，一般不推荐使用抗病毒药物。
二、疱疹性咽峡炎：常有发热、咽痛、口痛、咽峡部疱疹等表现。
1.可通过退热贴或头部冷敷等方式物理降温，同时使用布洛芬、对乙酰氨基酚等药物退热。
2.要注意营养支持治疗，进食困难的需补液治疗。此为自限性疾病，需注意增强免疫力。
在治疗期间，家长要注意给宝宝保暖，避免受凉使病情加重。饮食上多让宝宝吃清淡食物，切不可让宝宝喝生水、吃辛辣、刺激、生冷食物。
总之，当宝宝出现喉咙长疱疹且反复发烧的情况，应明确具体病因后采取针对性治疗措施，同时做好护理工作。