宝宝喉咙长疱疹且反复发烧，很可能是手足口病或疱疹性咽峡炎导致的。具体如下：
一、手足口病：
1.这通常由肠道病毒引起，宝宝除了喉咙出现疱疹、反复发烧，还常伴有咳嗽、流鼻涕、食欲不振等表现。
2.若宝宝体温超过38.5℃，可先通过温水擦浴、使用退热贴等方式进行物理降温，然后在医生指导下采用干扰素进行雾化治疗。因目前没有确切的抗病毒药物，所以一般不推荐使用抗病毒药物。
二、疱疹性咽峡炎：
1.会出现发热、咽痛、口痛、咽峡部疱疹等症状。
2.可通过退热贴或头部冷敷等方法物理降温，同时使用布洛芬、对乙酰氨基酚等药物退热，要注意营养支持治疗，进食困难的需补液治疗，因为其为自限性疾病，所以要注意增强免疫力。
在治疗期间，家长需注意给宝宝保暖，以防受凉使病情加重。饮食上多给宝宝提供清淡食物，绝对不能让宝宝喝生水，也不要让宝宝吃辛辣、刺激、生冷的食物。总之，当宝宝出现这些症状时，应及时就医并遵医嘱进行相应治疗和护理。