百日咳主要通过抗生素治疗来控制，通常发病早期（病程小于2周）使用抗生素效果较好，比如红霉素，一般用药后1-2周咳嗽会逐渐减轻。
首选抗生素有哪些
红霉素：属于大环内酯类抗生素，能抑制百日咳杆菌蛋白质合成，从而发挥抗菌作用，对百日咳有较好疗效。阿奇霉素：也是大环内酯类药物，同样可用于百日咳的治疗，相对来说服用方法相对简便些。
其他辅助治疗要注意啥
隔离休息：百日咳具有传染性，患者需要隔离，一般隔离时间至少要3-4周，避免将病菌传染给他人。特别是儿童患者，更要注意隔离，防止在幼儿园或学校内传播。保持环境通风：患病期间，室内要保持空气流通，每天开窗通风数次，每次15-30分钟，这样可以减少空气中病菌的浓度，有利于患者恢复。
特殊人群需特别关注
儿童患者：儿童是百日咳的高发人群，由于儿童的免疫系统和身体机能尚未发育完全，在治疗时要密切关注病情变化。比如儿童服用抗生素时，要严格按照儿童的体重等情况来考虑用药，但要注意不能自行随意调整剂量，一定要在医生指导下用药。成人患者：成人患百日咳后，也要积极治疗，同时要注意自身的休息，因为成人患百日咳可能会影响工作和生活，充足的休息有助于身体恢复，并且成人也要注意与家人隔离，避免传染给家人尤其是儿童等免疫力相对低的人群。