肛乳头瘤常见症状有肛门不适，比如早期可能感觉肛门有轻微的坠胀感，偶尔会有瘙痒，这种情况可能会持续存在。另外，部分患者会出现肛乳头脱出，当肛乳头增大到一定程度时，排便时可脱出肛门外，小的肛乳头脱出后可自行缩回，较大的则需用手推回，甚至长期脱出在外。
肛门不适表现
坠胀感： 患者常能感觉到肛门部位有隐隐的坠胀，这种坠胀感可能会在久坐、久站或者排便前后比较明显，有的患者一天中这种坠胀感会持续数小时不等。瘙痒： 由于肛乳头瘤刺激肛门周围的皮肤，会引起肛门局部的瘙痒，有时候瘙痒比较轻微，有时候可能比较严重，让人忍不住想去搔抓，但过度搔抓可能会导致肛门皮肤破损等问题。
肛乳头脱出情况
小肛乳头脱出： 较小的肛乳头脱出肛门后，一般在排便结束后，通过自身的括约肌收缩等作用可以自行缩回肛门内，患者可能只是在排便时偶尔发现有小的东西脱出，不太容易被察觉。大肛乳头脱出： 当肛乳头瘤较大时，脱出肛门外后不能自行缩回，需要用手将其推回肛门内。而且大的肛乳头脱出后长时间暴露在外，可能会引起疼痛、出血等情况，影响患者的日常生活，比如走路、坐下等都会受到一定影响。
其他可能伴随症状
排便不尽感： 患者会感觉大便排完后，还是有没排干净的感觉，总觉得肛门内还有东西，需要再次用力排便，但往往又排不出多少。便血： 部分患者在排便时，因为肛乳头瘤受到粪便的摩擦，可能会出现少量的便血，便血颜色一般是鲜红色，量通常不多，有时候可能在厕纸上看到少量血迹，或者大便表面有少量鲜血。不过要注意，便血也可能是其他肛肠疾病引起的，需要结合其他症状综合判断。