肛漏的治疗主要有手术和非手术等方式，手术是根治肛漏的主要方法，一般确诊后多需手术治疗。
手术治疗方式
肛瘘切开术：适用于单纯性低位肛漏，手术将瘘管全部切开，靠肉芽组织生长使伤口愈合。肛瘘切除术：对于低位单纯性肛漏，可将瘘管及周围病变组织切除后缝合创面，愈合较快。
非手术治疗情况
药物坐浴：可使用1：5000高锰酸钾溶液坐浴，每天2-3次，能清洁肛门，促进局部血液循环，减轻炎症。药物消炎：急性发作期可口服抗生素，如头孢类抗生素，有抗感染作用，但非手术治疗一般只能暂时缓解症状，不能根治肛漏。
术后护理要点
创面清洁：术后要保持肛门局部清洁，每次排便后用温水清洗，必要时坐浴，防止粪便残留感染创面。饮食注意：术后应多吃蔬菜水果等富含膳食纤维的食物，保持大便通畅，避免便秘，因为便秘会增加伤口裂开的风险；同时要避免吃辛辣刺激性食物，如辣椒、花椒等，以免刺激肛门。
治疗后的康复监测
定期复查：术后需定期到医院复查，一般术后1-2周左右要复查一次，观察伤口愈合情况，如有异常及时处理。观察复发迹象：肛漏有一定复发可能，要注意观察是否有肛门周围再次出现红肿、疼痛、流脓等复发迹象，一旦发现应及时就医。