孕后期臀部两侧骨头痛，主要与以下原因相关：
一、胎儿或羊水负荷过重：此时胎儿以及羊水的负荷过大，会致使后侧骶髂关节的负担明显加重，从而引发骶髂关节周围出现炎症，进一步导致此处产生疼痛。
二、骨质疏松：因为胎儿生长会大量消耗母体内的钙质，如果患者在此情况下营养跟不上，就容易诱发骨质疏松，随后便容易在腰椎、骨盆以及下肢等部位出现骨性疼痛。
三、肌肉疲劳：患者长时间挺起腹部，会造成臀部以及腰骶部位的肌肉产生疲劳，进而出现酸痛，有时会让患者误以为是骨性疼痛。
四、周围神经病变：可能在妊娠后期出现腰椎间盘突出或者坐骨神经痛等周围神经病变，继而引起此处放射性疼痛，使患者误判为骨性疼痛。
总结概况提示：孕后期臀部两侧骨头痛可能由多种因素引起，包括胎儿及羊水负荷、骨质疏松、肌肉疲劳和周围神经病变等，需要仔细甄别以明确具体原因。