习惯性拉肚子可能由多种原因引起。比如肠道感染后未完全恢复，部分人肠道在感染病菌后，即便感染已控制，肠道功能可能需要数周甚至数月才能完全恢复正常，约有10% - 20%的肠道感染患者会发展为慢性腹泻。
肠道疾病因素
炎症性肠病：像克罗恩病和溃疡性结肠炎，会导致肠道持续炎症，引起反复腹泻。克罗恩病可累及肠道任何部位，病程较长，容易反复发作。溃疡性结肠炎主要累及直肠和结肠，患者会出现黏液脓血便、腹泻等症状，且病情容易迁延不愈。肠易激综合征：这是很常见的功能性胃肠病，约有10% - 20%的人群受其困扰。患者精神紧张、压力大时容易发作，表现为腹痛、腹泻，排便后腹痛缓解，腹泻可为稀便或糊状便，每天数次不等。
饮食因素
食物不耐受：比如乳糖不耐受，约有70%的亚洲人存在乳糖不耐受情况，体内缺乏乳糖酶，无法完全消化牛奶等富含乳糖的食物，食用后就会出现拉肚子的情况。还有对麸质不耐受的乳糜泻患者，摄入含麸质的食物（如小麦、大麦、燕麦等）后会引发肠道不适和腹泻。饮食不规律：长期暴饮暴食、饥饱无常，或者经常吃辛辣、油腻、生冷食物，会刺激肠道，影响肠道正常的消化吸收功能，导致习惯性拉肚子。比如经常吃麻辣烫、冰镇饮料等，就可能破坏肠道菌群平衡，引发腹泻。
全身性疾病影响
甲状腺功能亢进：甲状腺激素分泌过多会加快肠道蠕动，使食物通过肠道的时间缩短，从而出现腹泻症状，约有20% - 30%的甲亢患者会有腹泻表现，同时还可能伴有多汗、心慌、消瘦等症状。糖尿病：糖尿病性神经病变可能影响胃肠道神经功能，导致胃肠蠕动紊乱，出现腹泻。特别是长期血糖控制不佳的糖尿病患者，约有5% - 10%会出现腹泻症状，腹泻可为间歇性，也可能持续存在。