女性膀胱炎通常由多种因素引起。一般来说，细菌感染是常见原因，大约80%的膀胱炎是由大肠埃希菌等肠道细菌逆行感染尿道引发的。
细菌感染因素
大肠杆菌为主因： 女性的尿道较短且直，距离肛门较近，大肠埃希菌等肠道细菌很容易从尿道外口进入尿道并上行至膀胱，从而引发膀胱炎。比如性生活时，可能会将细菌带入尿道，增加感染风险。其他细菌也可致病： 变形杆菌、克雷伯菌等细菌也可能导致女性膀胱炎，不过相对大肠杆菌来说几率较低。
局部防御机制问题
尿道黏膜脆弱： 女性尿道黏膜比较娇嫩，容易受损。如果频繁摩擦，像长时间骑自行车等，就可能损伤尿道黏膜，让细菌更容易入侵引发膀胱炎。阴道分泌物影响： 女性阴道周围的分泌物如果没有及时清理，也可能影响尿道周围环境，为细菌滋生创造条件，增加膀胱炎发生的可能性。
机体免疫力因素
免疫力低下时易发病： 当女性身体免疫力较低时，比如患有糖尿病、长期使用免疫抑制剂等情况，身体抵御细菌的能力下降，就更容易患上膀胱炎。例如糖尿病患者血糖控制不佳时，白细胞的杀菌功能会受到影响，细菌就容易在膀胱内繁殖引发炎症。经期免疫力波动： 女性在经期时，身体免疫力会有一定波动，此时尿道周围的防御能力相对减弱，也比较容易发生膀胱炎。