婴儿乳糖不耐受主要表现为消化系统相关症状。通常婴儿乳糖不耐受时，会出现腹泻症状，每日腹泻次数可能达到数次至十余次不等，大便多为黄色或青绿色稀糊便，或呈蛋花汤样，泡沫多，有奶块。
消化系统方面的典型症状
腹泻表现： 婴儿乳糖不耐受最常见的就是腹泻，大便性状多为稀水样，可能伴有奶瓣。一般每天腹泻次数较多，有的宝宝一天腹泻5 - 10次甚至更多。腹胀情况： 宝宝的小肚子会看起来比较鼓，出现腹胀现象。这是因为乳糖不能被正常消化吸收，在肠道内被细菌发酵产气，导致肠道内气体增多，引起腹胀。
其他伴随症状
哭闹不安： 由于腹部不适，宝宝会经常哭闹，尤其在吃奶后可能会哭得更厉害。因为吃奶过程中摄入了乳糖，加重了肠道的不适，从而通过哭闹来表达身体的不舒服。呕吐现象： 部分婴儿乳糖不耐受时还可能出现呕吐情况，呕吐物多为吃进去的奶液，呕吐次数一般不多，但也有个别宝宝呕吐较频繁。
不同类型的乳糖不耐受症状差异
先天性乳糖不耐受： 宝宝一出生就会出现症状，通常在出生后数天内就会有腹泻、腹胀等表现，而且症状比较严重，可能影响宝宝的生长发育，因为营养物质不能很好地被吸收。继发性乳糖不耐受： 多是由于宝宝肠道受到感染等因素影响后出现的，比如宝宝患了肠炎等疾病后，肠道内的乳糖酶受到损伤，进而出现乳糖不耐受症状。一般在原发病治疗过程中或之后会逐渐显现，腹泻等症状的严重程度与肠道受损程度有关。