霉菌性龟头炎可以用抗真菌药物治疗，一般规范用药1-2周左右能有较好效果。
外用抗真菌药物
克霉唑乳膏： 属于广谱抗真菌药，通过抑制真菌细胞膜的合成及影响其代谢过程来发挥作用。可以直接涂抹在龟头患处，一天使用2-3次，用药时要注意清洗局部，保持干燥清洁。咪康唑乳膏： 对多种真菌尤其是白色念珠菌有抗菌作用，能干扰真菌细胞色素P-450的活性，从而影响真菌细胞膜的合成。用法也是局部外用，早晚各涂一次。
口服抗真菌药物
氟康唑胶囊： 适用于较严重的霉菌性龟头炎情况。它能抑制真菌细胞色素P-450的活性，阻碍真菌细胞膜主要固醇类麦角固醇的生物合成，损伤真菌细胞膜并改变其通透性，导致细胞内重要物质漏失。成人一般首次剂量0.2克，之后一天0.1克，具体需遵医嘱。不过孕妇、哺乳期妇女以及肝功能不全者要慎用。伊曲康唑胶囊： 也是一种高效、广谱、口服的三唑类抗真菌药物。它可以高度选择性地抑制真菌细胞色素P-450的活性，从而抑制真菌细胞膜上麦角固醇的合成，发挥抗菌作用。一般用法是每次0.2克，一天一次，连服7天，同样有一些人群需要谨慎使用，比如有严重肝脏疾病的患者等。
日常护理配合
保持局部清洁： 每天用清水清洗龟头部位，避免使用刺激性强的洗液，清洗后要及时擦干，保持干燥，这有助于抑制真菌的生长繁殖。比如每天至少清洗1-2次，特别是在性生活后和运动出汗后更要注意清洗。避免刺激： 患病期间要避免性生活，防止交叉感染，同时要穿宽松、棉质的内裤，减少局部的摩擦和闷热，让龟头能处于相对舒适的环境，利于病情恢复。如果内裤有污染要及时更换。