维生素B1缺乏时，早期可能出现疲乏、淡漠、食欲减退、恶心、忧郁、急躁、沮丧等症状。如果长期严重缺乏，会引发典型的脚气病，分为干性脚气病和湿性脚气病等类型。
神经系统方面的缺乏症状
周围神经炎表现： 会出现感觉异常，比如手脚有麻木、针刺样、烧灼样的感觉。严重时还可能影响肌肉功能，导致肌肉力量减弱，行走困难等。成人如果维生素B1缺乏，神经系统症状相对缓慢出现，而婴儿缺乏维生素B1时，神经系统症状较为突出，可能表现为烦躁、哭声嘶哑，甚至出现嗜睡、昏迷等情况。中枢神经系统影响： 严重的维生素B1缺乏可能影响中枢神经系统，导致反应迟钝、情感淡漠、记忆力下降等，还可能出现惊厥、昏迷等严重表现。
心血管系统方面的缺乏症状
湿性脚气病表现： 主要影响心血管系统，导致心脏功能异常。患者会出现心悸、气促，心脏扩大，严重时可出现心力衰竭。例如，患者可能在活动后明显感到呼吸困难，心率加快，体检时能发现心脏增大等体征。循环系统改变： 维生素B1缺乏会影响丙酮酸的代谢，导致丙酮酸在体内堆积，进而影响心脏的正常功能。使得心脏输出量减少，外周血管扩张，出现低输出量型高排血量综合征等情况。
消化系统方面的缺乏症状
食欲减退与消化功能紊乱： 维生素B1缺乏会影响胃肠道的蠕动和消化液的分泌，导致食欲减退，患者不想吃东西。同时可能出现消化不良，表现为腹胀、便秘等症状。长期缺乏还可能影响营养物质的吸收，导致体重减轻等情况。胃肠道平滑肌功能异常： 胃肠道平滑肌活动受影响，会出现蠕动减慢、张力降低等情况，进一步加重消化功能的紊乱，可能引发恶心、呕吐等症状。