肛乳头瘤常见的症状有排便不尽感，部分患者在排便后会感觉肛门内有组织物未完全排出，这种情况可能会持续存在，尤其在大便较干燥时更为明显。另外，肛门瘙痒也是常见症状之一，由于肛乳头瘤可刺激肛门周围皮肤，导致分泌物渗出，进而引起肛门部位的瘙痒感，有时瘙痒较为顽固，会影响患者的日常生活。
常见症状表现
排便不尽感： 患者在排便后，总觉得肛门内还有粪便残留，有未排干净的感觉，这种情况可能会频繁出现，特别是当大便质地偏干硬时，这种不尽感会更加明显。一般来说，这种症状会间断性发作，时轻时重。肛门瘙痒： 肛乳头瘤会使肛门部位的分泌物增多，这些分泌物会刺激肛门周围的皮肤，从而引发瘙痒。患者会不自觉地搔抓肛门，长期搔抓可能会导致肛门皮肤破损、皲裂等情况。而且这种瘙痒感在夜间可能会加重，影响患者的睡眠质量。
其他伴随症状
肛门肿物脱出： 较小的肛乳头瘤一般不易脱出肛门外，但当肛乳头瘤增大到一定程度时，在排便过程中，由于粪便的挤压，可能会使肛乳头瘤脱出肛门。初期肿物脱出后可自行缩回，随着病情发展，肿物脱出后需用手推回甚至无法回纳。例如，有些患者在排便时会发现有小的肿物从肛门脱出，开始时能自己缩回去，后来需要用手推才能回去。肛门疼痛： 当肛乳头瘤脱出肛门外发生嵌顿，或者受到炎症刺激时，患者会感到肛门部位疼痛。疼痛的程度因人而异，有的患者只是轻微的胀痛，而有的患者疼痛较为剧烈，行走、排便等动作都可能会加重疼痛症状。比如，嵌顿的肛乳头瘤会导致肛门局部血液循环障碍，引起剧烈疼痛。