如果在佩戴隐形眼镜时感觉眼睛疼痛，可能是由以下原因引起的：
1.佩戴方式不正确：在佩戴隐形眼镜之前，需要彻底清洁双手，并确保指甲修剪整齐，以免刮伤角膜。如果佩戴方式不正确，可能会导致角膜缺氧、水肿，从而引起疼痛。
2.眼部感染：如果隐形眼镜护理不当，可能会导致细菌、真菌或病毒感染，从而引起眼部炎症，导致眼睛疼痛、红肿、流泪等症状。
3.隐形眼镜过期：隐形眼镜也有使用寿命，如果超过使用寿命，可能会导致镜片变形、磨损，从而引起眼部不适。
4.眼部干燥：长时间佩戴隐形眼镜，可能会导致眼睛干燥，从而引起疼痛。
5.其他眼部问题：如果本身患有结膜炎、角膜炎、干眼症等眼部疾病，佩戴隐形眼镜可能会加重病情，从而引起眼睛疼痛。
如果在佩戴隐形眼镜时感觉眼睛疼痛，应立即停止佩戴，并及时就医。医生会进行详细的眼部检查，以确定疼痛的原因，并给予相应的治疗。在治疗期间，应避免佩戴隐形眼镜，以免加重病情。同时，应注意眼部卫生，避免揉眼、用眼过度等。